В северных районах Западной Сибири в апреле еще преобладает морозная погода с низкими температурами и метелями. Весна проявляется здесь в обилии солнечного света, более частыми становятся оттепели.
На фоне общего потепления для апреля характерны резкие похолодания при вторжениях арктического воздуха.
Средняя месячная температура апреля еще отрицательная по северу территории: в Заполярье Ямало-Ненецкого автономного округа – минус 7…14 °С, местами в Ханты-Мансийском автономном округе – минус 1…5 °С, на севере Томской области – минус 1…3 °С, в направлении на юг территории она повышается до 0…плюс 6 °С. Устойчивый переход среднесуточной температуры воздуха через 0 °С к положительным значениям во второй декаде апреля происходит повсеместно до районов ХМАО, к концу месяца через плюс 5 °С по линии Тобольск-Новосибирск-Бийск, к северу и востоку от этой линии, а также в горных районах Алтая он происходит в мае. В южных районах Западной Сибири максимальная температура воздуха может ежегодно подниматься до плюс 10 °С, местами до плюс 20 °С.
Самые теплые апрели за последние 30 лет отмечались в 1991, 1995, 1997, 2000, 2007, 2012, 2013, 2015, 2020 годах, когда аномалия среднемесячной температуры воздуха составляла местами плюс 5…8 °С. Максимальная температура в эти годы повышалась до плюс 20…25 °С. В апреле 1972 года температура воздуха в отдельные дни апреля достигала плюс 30…33 °С.
Самые холодные апрели отмечались в 1992, 2004, 2006 годах. Аномалия среднемесячной температуры воздуха апреля этих лет местами достигала минус 6…8 °С. Минимальная температура понижалась до минус 30…35 °С. В апреле 1964 года абсолютный минимум местами составил минус 36…41°С (Кондома Кемеровской области).
Месячное количество осадков составляет 14–37 мм, в горных районах и в предгорьях 39–70 мм, в Кош-Агаче Республики Алтай 4 мм.
Наибольшее суточное количество осадков по территории обслуживания составляет 13-40 мм, в Республике Алтай до 50 мм.
Метели в апреле наблюдаются не ежегодно. Среднее число дней с метелью составляет 2-3 дня, на севере территории до 10-12 дней.
Средняя скорость ветра составляет 1–6 м/с. Число дней с ветром, превышающим 15 м/с, изменяется от 3 до 8, местами до 10 в зависимости от орографии.
Туманы в апреле бывают реже, чем в марте. В течение месяца отмечается 3-4 дня с туманом.
Даты разрушения устойчивого снежного покрова близки к датам перехода температуры воздуха через 0 °С, а в третьей декаде наблюдается сход снежного покрова в южной части территории. По северу Западной Сибири снежный покров сохраняется до конца апреля, а в отдельные годы задерживается и на территории, где он обычно сходит в начале или середине месяца.
Южнее 60° с.ш. в отдельные годы в течение 1-2 дней могут наблюдаться грозы.